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생명과학 이야기54

DeepGoWeb을 통한 한가지 기능 예측시도 안녕하세요? 이번 포스팅은 오랫만에 생명과학이야기라고 할 수 있는데, 일단 여기서는 다른것도 아니고 유전자의 기능을 한번 알아보기 위해서 DeepGoWeb이라는 툴을 이용해서 알아보는 과정을 한번 다루어 보고자 합니다. 일단 이 탐색은 실패로 끝나기는 했지만, 그래도 포스팅할 가치는 있다고 생각을 해서 이번 포스팅을 준비하게 되었습니다. 일단 이렇게 준비를 했기 때문에, 어떻게 해서건 작업을 들어가 보고자 합니다. 먼저 원하는 DNA sequence를 입력해서 위 스크린샷과 같이 예측되는 결과를 얻도록 합니다. 여기서 정말 중요하다고 생각하는 것은 저 발생과정에서 이 유전자가 관여하는 지를 알아보는 것 입니다. 먼저 발달과정을 클릭해서 나오는 윈도우 입니다. 이런 윈도우에서 당장은 얻을 것이 없어 보이기.. 2022. 12. 23.
플라세보 효과에 대한 연구 안녕하세요? 플라시보 혹은 플라세보 (placebo) 라는 위약 효과에 대해서는 정말로 이 블로그에서도 잠깐이지만 다룬 적이 있었지만, 그때는 그렇게 크게 다루지는 않았습니다. 링크 : 플라시보(위약) 효과란 강력합니다. 그런데 일본에 있는 이화학 연구소의 생명기능과학 연구센터의 연구팀ㅂ이 2018년 11월에 시행한 연구에서 어느정도 이 위약효과에 관한 매커니즘(기작)을 알아냈습니다. 먼저 신약의 개발에서도 상당수의 경우에 있어서 저 '위약효과'보다 더 개선이 되는 효과를 얻지 못해서 '약효가 있다' 라고 인정을 받지를 못하고 있으며, 경우에 따라서는 이 '위약효과'만으로도 어떻게 치료의 효과를 보는 경우도 있기에 무어라 말하기는 상당히 곤란 하기는 합니다. 기존에는 뇌속에서 분비가 되는 '내인성인 오피.. 2019. 11. 24.
사람의 성격을 결정할 수도 있는 미생물들? 안녕하세요? 제목이 무언가 고개를 갸우뚱 하게 만들 수도 있지만, 모든 미생물이 다 사람의 성격에 영향을 미친다는 것이 아니고, 이번 포스팅에서 다루고자 하는 것은 바로 '장내 미생물'입니다. 우선 예전에 포스팅을 하였는 내용 중에서, 인체에는 거의 2번째 뇌에 해당할 지도 모르는 신경계가 있다고 합니다. 링크 : 두번째 뇌까지는 아니지만, 상당히 중요한 신경계가 있다고 합니다. 그때 2017년 봄에서는 이것이 인간의 뇌, 다른 동물도 그렇지만, 뇌의 신경과 직접적인 관련이 있으리라 생각을 했는데, 실제로 요 최근에는 관련이 있다는 사실을 '무균 마우스'라고 해서, 쥐의 몸속에 모든 공생 미생물이 없는 쥐를 이용한 실험에서 관련된 내용이 나왔습니다. 먼저 뭐가 무엇인지 헷갈리실 분들을 위해서 소장의 단면.. 2019. 2. 12.
에피게놈(epigenome) 편집 기술 안녕하세요? 어떤 사람들은 유전자 조작기술이 간단하게 되는 것으로 생각하기도 하시겠지만, 실상은 대학원의 박사과정에 들어간 학생이 끙끙대며 설계를 제대로 해도 될까 말까 합니다. 물론 처음부터 모든 DNA서열을 조립하는 것은 아직은 먼나라 이야기 이기도 하기에, 요 근래에 들어서 나온 '크리스퍼/캐스나인-crispr/CAS9'이 왜 대단한 것인지 생각하면, 아직도 유전자 조작은 어려운 상황 이기는 합니다. 링크:유전자를 절단하는 효과적인 가위-크리스퍼/캐스나인-cripsr/CAS9에 대한 이야기 그러나 결국 crispr/CAS9도 유전자를 자르는 가위라는 점에서, 어느정도 문제를 내포하고 있기는 있습니다. 위 링크를 타고 들어가서 한번 내용을 읽어 보시면, 만약 유전자 A가 너무 발현이 되어서 문제가 된.. 2018. 11. 4.