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파이썬1297

이제 겨우 Blast의 결과를 가져오는데 성공했습니다. 안녕하세요? 지난번 포스팅에서 너무 느린것이 문제라는 것을 언급했었는데, 이번에는 방식을 바꾸어서 blast의 웹페이지에서 결과를 가지고 오는 방식으로 바꾸도록 했습니다. 굳이 비교하자면 수냉식 엔진이 편리할 것 같아서 사용하고자 했는데, 무게가 너무 무거운 문제가 있어서 공냉식 엔진으로 바꾸었다고 해야 할까요? 이런 차이가 있습니다만, 아무튼 제 기준에는 여전히 느리지만, 그래도 이전에 비해서는 매우 빨라진 방식으로 blast 결과를 가지고 올 수 있게 되었습니다.  가장 먼저 가지고 와야 하는 것으로는 먼저 requests라는 모듈을 가지고 오는 것이고, 그 다음으로 결과를 읽어서 사람 눈으로 보기 편하게 만들기 위해서 io에서 StringIO라는 모듈을 가지고 오기로 했습니다. 사실 이렇게 코드를 .. 2024. 5. 16.
문제가 분명히 있는 이 구문 안녕하세요? 요 최근까지 주어진 DNA시퀀스를 입력하면, 자동으로 파이썬을 통해서 Blast라는 데이터 베이스에서 데이터를 가지고 오는 프로그램을 만들고 있었습니다만, 여기서 사소한게 아니라 심각한 문제가 하나 나오는 것을 발견할 수 있었습니다. 바로 아래의 스크린샷에서 보이는 코드입니다.분명히 NCBIWWW.qblast를 통해서 blast에서 데이터를 가지고 오라고 요청을 한 것 까지는 좋았는데, 문제는 이 속도가 느려도 보통 느린 것이 아니라는 것 입니다. 이걸 파이썬, 특히 파이참에서 요청을 해서 결과를 보기까지 걸리는 시간이, 그 사이면 수동으로 같은 길이의 시료를 돌려서 5개 정도 결과를 얻을 시간이 되면 겨우 하나가 나오는, 즉 수작업을 해서 걸리는 시간의 5배나 걸린다는 겁니다. 왜 이러는 .. 2024. 5. 14.
다시금 겨우겨우 구현이 된 드레그 안녕하세요? 일단 일요일은 이래저래 다시 월요일을 준비한다고 상당히 많은 일이 있었는데, 그런다고 해서 전혀 이 프로젝트를 진행하지 않은 것은 아니기는 아닙니다. 다만, 그 진도를 나아가는 정도가 많이 줄어들기는 줄어든 것은 사실입니다. 이건 어쩔 수 없는 상황이기는 합니다만, 아무튼 그래도 진도를 나아간 정도 까지는 어떻게 포스팅으로 올려 보고자 하는 생각에 이번 포스팅을 올리게 되었습니다. 일단 기존에 있었던 코드외에 다른 것을 한번 더 지정해 보도록 했습니다. 이렇게 하는 것으로 해서 우선 드레그 하는 기능이 구현될 수 있는지 없는지 일단 알아봤습니다. 이렇게 해서 일단 하나 만들어 지자마자 우선 드레그해서 이동이 가능한 것 까지는 어떻게 구현이 되기는 되었습니다. 다만 문제가 여기서 하나 벌어졌습.. 2022. 10. 30.
Godot을 익히기 위한 과정 -1- 안녕하세요? 어떻게 해서 드레그 앤 드롭으로 사용하기 편한 프로그램을 만드는 것인가 하고 하다가 결국 이 카드를 빼들고 말았습니다. 일단 여기서 해야 할 것으로는 다른 것도 아니라 우선, godot이라고 하는 이 무료 게임엔진을 이용해 보기로 했습니다. 다만 이걸 사용하는 것도 어느정도 적응이 필요해서 우선 따라하기만 하는 기초저인 과정은 거쳐야만 했습니다. 가장 먼저 해야 하는 단계가 다른 것도 아니라 바로, 프로젝트를 생성하는 단계라고 할 수 있습니다. 이 단계는 검을 배우면서 검을 집어넣고 빼는 것을 익히는 단계인데, 간단해 보이면서도 상당히 중요하다면 중요한 스탭이라고 할 수 있습니다. 그리고 나서 다음으로 진행을 하고자 하는 것은 우선 키보드에 의해서 조종이 되는 노드를 먼저 만들고, 이 노드에.. 2022. 10. 9.

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